Немухин ярко проявил себя и в декоративно-прикладном искусстве. Он стал одним из первых художников-шестидесятников, начавших активно работать с фарфором. Именно его тарелки, созданные в технике деколи, положили начало авторскому фарфору второго русского авангарда. Его работы выпускались в Люксембурге, России и Германии.
Особое место в наследии мастера занимает скульптура — в основном, посвящения людям, повлиявшим на его творческое развитие. Пространственные композиции из дерева и бронзы создают удивительно точные и лаконичные образы. Например, работа, посвященная поэту и художнику Максимилиану Волошину, воплощает его девиз: «Все видеть, все понять, все знать, все пережить».